03-27 我国自主完成首个果树作物基因组序列图谱

日期：2012-03-27　　访问次数：3598

记者近日从华中农业大学获悉，该校组织园艺学、基因组学、生物信息学等学科的科研人员，经过一年多的攻关，完成了甜橙基因组拼接与注释，获得了较高质量的甜橙基因组。这是我国自主完成的第一个果树作物基因组序列图谱。

柑橘是世界最重要的果树之一，其栽培面积和产量在所有果树中排名第一。甜橙是世界第一大柑橘类型，产量占全世界柑橘产量的60%左右，且橙汁是世界三大饮料之一。但甜橙具有多胚、雄或/和雌不育、遗传背景高度杂合等特点，阻碍了遗传学及育种的发展。完整的基因组信息，作为一个遗传框架，将为柑橘遗传与育种改良提供依据。

据介绍，甜橙有9对染色体，基因组大小为367 M。甜橙基因组测序采用全基因组鸟枪法(WGS)策略，基因组注释结合了丰富的基因表达数据，包括愈伤组织、叶、花和果实等组织的转录组，并引入RNA-PET技术对基因转录产物注释，获得注释的基因约3万个。通过遗传标记和染色体原位杂交分析，将基因组序列整合到9条染色体。通过比较发现，甜橙和葡萄、草莓的共有基因分别为81%和83%。还发现，甜橙基因组中有51%的基因位点处于杂合状态。

我国是世界上重要的柑橘原生中心，栽培柑橘类型十分丰富，分为柑、橘、橙、柚、柠檬、金柑、枸橼以及观赏的四季橘。2010年我国总产量2645万吨，种植面积为221万公顷，是世界柑橘第一生产大国。

据华中农业大学校长、著名柑橘专家邓秀新院士介绍，甜橙基因组的完成将为国内外同行研究芸香科（柑橘）的特殊生物学性状、功能基因组提供重要平台，同时对于果实包括色、香、味、成熟期等重要性状基因的发掘及品种改良具有重要意义，表明我国柑橘基础研究跻身世界前沿，对提升产业竞争力有重大意义。（记者 刘志伟 通讯员 范敬群）

来源： 科技日报